國研院攜手NVIDIA抗疫!台灣AI雲提供基因定序軟體加快分析

國研院攜手NVIDIA抗疫!台灣AI雲提供基因定序軟體加快分析。(畫面來源:翻攝自國研院官網)

【新唐人亞太台 2020 年 04 月 20 日訊】國家實驗研究院國家高速網路與計算中心(國研院國網中心)於本月初甫啟動「御守臺灣・科技抗疫」專案[i],釋出國際級超級電腦「臺灣AI雲」[ii]之計算力、儲存及大數據資料集等資源,免費開放各界提案申請運用抗擊疫情。今(4/20)日更進一步宣布,與長期合作夥伴NVIDIA攜手,即日起在臺灣AI雲上提供Parabricks基因定序軟體[iii],讓申請科技抗疫專案的研發者可以無償免費使用90天。以臺灣AI雲搭配Parabricks中的分析工具,將加快醫療研發分析基因組定序資料的速度達50 倍,強化臺灣以科技抵禦新冠病毒(COVID-19)的能量。

因應當前新冠病毒構成的全球大流行,國研院國網中心以最先進的AI超級電腦臺灣AI雲,以及超過5萬個資料集的資料集平台資源,作為抗疫的最佳後盾,幫助開發者針對疫情所帶來的各面向問題,提出最佳的研究方法與解決方案。而NVIDIA 所提供的Parabricks基因定序軟體,則是針對醫療的研究提供助益,讓用於執行次世代基因定序(NGS)DNA數據的二次分析的軟體,以超快速度和低成本方式,從原本的數日減少至不到一小時,便可產出分析結果。同時,這套軟體能夠辨別資料裡的突變和變異情況,讓醫療專業人員能藉由患者基因找出治療方式,並掌握病毒的演變歷程,加速疫苗的開發。

以專業的基因定序軟體,搭配臺灣AI雲全球最高規格的AI運算能力,國研院國網中心與NVIDIA跨國合作,集結頂尖資源,希望能以更大能量協助產學研各界共同對抗疫情衝擊。同時,國網中心的資料集平台也已蒐集提供COVID-19特色相關資料集,內含全球釋放之肺炎影像、醫療論文、健保特約機構口罩剩餘數量明細(含地理加值)、全球確診統計資料等,提供志同道合夥伴們取用與加值,讓大家一起努力,用科技守護台灣。

國研院國網中心史曉斌主任表示,很高興臺灣科技抗疫的努力,能有國際夥伴的合作協力。臺灣AI雲將持續以一流的高速運算與大數據平台,集結國際能量,作為國家科技研發的堅強後盾。

 

[1] 次世代定序( Next Generation Sequencing, NGS):是指傳統定序法的改良版,可進行高速大量且高精度的核酸定序。

 

[i]「御守臺灣 科技抗疫」專案:為加速產出能有效遏阻COVID-19疫情、維持社會運作或穩定人民生活的各式解決方案,國研院國網中心公開徵求各界提案,徵件主題以防疫出發,但不限於防疫議題,亦可包含解決人民生活不便、有助企業或學校穩定運作、紓困及振興經濟、穩定民心等面向,特提供超級電腦運算資源及相關資料集給有需求者使用,即日起至2020年6月30日止接受申請。詳情請見:https://www.nchc.org.tw/Page?itemid=28&mid=43

[ii]臺灣AI雲:是採用臺灣杉二號超級電腦為運算之雲端平台,以最新之容器化技術提供服務,透過優化過的AI軟體堆疊,開發人員可快速佈建開發環境,可比過往增加40%的工作效率;同時支援大量調度節點與GPU,跨節點高速平行運算效能相較現行雲服務增進30%。除提供快速運算能力、大量儲存空間及安全的網路外,此平台亦將整合國內各界發展之AI程式與工具,以及國內外重要資料集,彙集成為國內最大的模式市集與資料市集,提供產學研界更即時、更便利的運算服務。詳情請見:https://www.twcc.ai/

[iii]Parabricks基因定序軟體:加速科學的發展始終是 NVIDIA 的核心使命之一。NVIDIA與國研院國網中心全力協助台灣研究人員,以提供研究人員運算資源與建置在平台上的Parabricks軟體,進一步分享可提供雲端存取NVIDIA GPU以及Parabricks軟體的相關資源。可透過白皮書線上研討會新聞YouTube及加入開發者社區深入了解Parabricks。

 

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